محمد حسین کریمی جعفری

محمد حسین کریمی جعفری

مرتبه علمی : دانشیار
  • عضو هیات مدیره انجمن بیوانفورماتیک ایران
  • معاون اجرایی و دانشجویی
  • بازرس اصلی انجمن بیوانفورماتیک ایران
موسسه بیوشیمی بیوفیزیک
Scopus
  • ۲۹۸ ارجاعات
  • ۱۱ h-Index
تا تاریخ : ۱۴۰۲/۱۱/۲۵

پایان نامه ها و رساله ها

  • ۲۴ پایان نامه ها

بازسازی مدل متابولیکی مبتنی بر ژنوم هلیکوباکترپیلوری و کاربرد آن در شناسایی هدفهای دارویی

سپیده مفیدی فر (دانشجو مقطع: دکتری. تاریخ دفاع: ۱۴۰۳/۴/۴) ، محمد حسین کریمی جعفری

مهندسی متابولیک سامانه‌ای باسیلوس سوبتیلیس به منظور افزایش تولید پروتئاز قلیایی

آوا جهادمحمدی (دانشجو مقطع: کارشناسی ارشد. تاریخ دفاع: ۱۴۰۲/۶/۲۷) ، محمد حسین کریمی جعفری، علی محمد بنائی مقدم
مهندسی متابولیک سامانه ای
شبکه متابولیک ژنوم مقیاس
پروتئاز قلیایی
پروتئاز خنثی
باسیلوس سوبتیلیس
neutral protease
moma
fseof
bacillus subtilis
alkaline protease

تحلیل پویایی پروتئین با استفاده از شبکه زمانمند، یک روش تشخیص مولفه های کلیدی

زهرا موسوی موحدی (دانشجو مقطع: دکتری. تاریخ دفاع: ۱۴۰۲/۶/۲۶) ، محمد حسین کریمی جعفری

مدل سازی برهم کنش های پپتید-پروتئین با تمرکز بر سیستم ایمنی تطبیقی

فرزانه میمندی پاریزی (دانشجو مقطع: دکتری. تاریخ دفاع: ۱۴۰۲/۱۲/۲۶) ، محمد حسین کریمی جعفری

شناسایی ویژگیهای تمایزگذارنده بین سلولهای سالم و سرطانی از طریق مدلسازی متابولیکی در سطح سیستم

فریبا روشن ضمیر (دانشجو مقطع: دکتری. تاریخ دفاع: ۱۴۰۱/۱۱/۲۳) ، محمد حسین کریمی جعفری

تلفیق روش های داکینگ و یادگیری هنگرد به منظور بهبود پیش بینی بر همکنش های پروتئین - لیگاند

سارا محمدی (دانشجو مقطع: دکتری. تاریخ دفاع: ۱۴۰۰/۱۲/۱۸) ، محمد حسین کریمی جعفری

بررسی نقش ویژگی های فیزیکوشیمیایی پپتیدهای ضدمیکروبی در سمیت سلولی و بر همکنش آن ها با غشا

حسین خبازخوب (دانشجو مقطع: دکتری. تاریخ دفاع: ۱۴۰۰/۱۱/۳۰) ، محمد حسین کریمی جعفری، باقر باباعلی، علی اکبر صبوری
شبیه سازی دینامیک مولکولی
سمیت سلولی
molecular dynamics simulation
ویژگی های فیزیکوشیمایی پپتیدها
غشای یوکاریوتی
پپتیدهای ضدمیکروبی
antimicrobial peptides
machine learning
peptide toxicity
physico
chemical properties

توصیف متابولیکی سلولهای واقع بر منظره وادینگتون

سعیده خدایی (دانشجو مقطع: دکتری. تاریخ دفاع: ۱۳۹۹/۷/۳۰) ، محمد حسین کریمی جعفری
روش برپایه اورتولوژی
منظره اپی ژنتیک
شبکه متابولیکی در مقیاس ژنوم
min
imm۱۸۶۵
epigenetic landscape
genome scale metabolic (gsm) model
orthology
based

بکارگیری روش های مکانیک کوانتومی نیمه تجربی به منظور تخمین قدرت اتصال مولکول های کوچک دارویی با برخی پروتئین های دخیل در انواع سرطان مانند کیناز های وابسته به سیکلین

صالح باقری (دانشجو مقطع: دکتری. تاریخ دفاع: ۱۳۹۹/۱۱/۷) ، محمد حسین کریمی جعفری، حسن به نژاد
داکینگ مولکولی
مکانیک کوانتومی نیمه تجربی
کیناز وابسته به سیکلین ۲
تماس های نامطلوب
بهینه سازی لیگاند
bad contacts
cdk۲
ligand optimization
molecular docking
semiempirical quantum mechanics

طراحی سامانمند هنگرد ساختاری پروتئین های بی نظم ذاتی

نجمه صالحی (دانشجو مقطع: دکتری. تاریخ دفاع: ۱۳۹۷/۱۱/۲۷) ، محمد حسین کریمی جعفری، مهریار امینی نسب